Coronavirus, cine sau ce și de ce? Ce origine?

Obamot a scris:Du coup, comme tous les labos P4 coopėrent et s’échangent les virus, que l’Institut Pasteur y travaille (et aurait déposé des brevets sur le SARS-cov-x). Pourquoi pas depuis la France, avec un colis infecté, qui aurait contaminé un postier chinois ?

Le 31 décembre, Pékin a informé l'Organisation mondiale de la Santé (OMS) d'un foyer de pneumonies d'origine inconnue à Wuhan, premier épicentre de l'épidémie. Pour les premiers cas, les autorités sanitaires de Wuhan parlent du 8 décembre. Une étude publiée dans The Lancet évoque l'identification d'un premier patient le 1er décembre.

Les diverses études phylodynamiques -- qui analysent les variations génétiques du virus -- ne contredisent pas ces dates. « Les données vont dans le sens d'une origine probable de l'épidémie en novembre ou en décembre 2019 », indique le Dr Volz. Un rapport de l'Imperial College en collaboration avec l'OMS fait ainsi remonter « l'ancêtre commun » du virus au 5 décembre (avec une marge d'incertitude entre le 6 novembre et le 13 décembre). Andrew Rambaut, de l'Université d'Édimbourg, conclut à un ancêtre commun datant du 17 novembre (marge entre le 27 août et le 29 décembre).

« C'est normal qu'un nouveau virus circule sans être détecté pendant des semaines avant d'être découvert », souligne le Dr Volz. À ce jour, les génomes de plus de 15.000 virus Sars-Cov-2 ont été séquencés, permettant de tracer sa circulation grâce à son évolution génétique. À chaque fois qu'il se réplique, le virus produit des mutations (aucune n'ayant modifié sa virulence). « De temps en temps, par hasard, des mutations se fixent », explique Samuel Alizon.

Pour le Sars-Cov-2, « on compte en moyenne deux mutations par mois qui se fixent, [alors] si vous comparez deux virus, vous pouvez compter combien de mutations les séparent », poursuit-il. En remontant la chaîne, on trouve « l'ancêtre commun à toutes les infections ». Un ancêtre qui se trouvait en Chine. « Tous les virus qui circulent dans le monde descendent des lignées » proches de Wuhan, insiste le Dr Volz.

Un papier fait état d'une forte prévalence des anticorps du SARSCoV2 (IgG/IgM) en Italie à partir de début septembre. Si l'on tient compte d'une à deux semaines nécessaires à la séroconversion, cela signifie que le COVID19 était largement diffusé en Italie en août ou avant.
(...)
Compte tenu de toutes les autres preuves disponibles, la circulation du SARSCoV2 en Italie en août est une affirmation très forte, qui nécessiterait des preuves solides. Le document ne présente pas d'arguments convaincants. Les méthodes sont mal expliquées et aucun contrôle négatif ou positif n'est fourni.
Il est possible qu'elles aient détecté une réactivité croisée avec deux HCoVs endémiques du "rhume commun" (OC43 et HKU1), qui présentent une homologie assez élevée dans certaines régions de la protéine spike. Il est cependant difficile d'en être sûr, étant donné le peu de preuves fournies dans le document.
À moins qu'elles ne soient confirmées par des preuves bien meilleures, je pense que l'allégation du COVID19 circulant en Italie en août peut être ignorée sans risque. La plupart des preuves indiquent l'émergence du SARSCoV2 en ~Oct/Nov 2019 en Chine, et une propagation en Europe (Italie du Nord) en ~Nov/Déc 2019.
C'est un cas typique de ce qui ne va pas avec la science (et le reporting scientifique) à l'époque du COVID19. Des affirmations solides appuyées par des preuves peu convaincantes sont largement diffusées sans que l'examen et la prise en compte nécessaires d'un ensemble plus large de preuves disponibles ne soient effectués.

Obamot a scris:Rien n’exclut donc que le point zéro puisse se trouver partout ailleurs dans le monde.
Surtout si il provient d’un labo P4 qui prend des précautions pour transférer des virus d’un labo à un autre.

VetusLignum a scris:Un très bon article (mais aussi très long) sur les recherches en cours sur l’origine du virus :
https://mygenomix.medium.com/fearsome-v ... 6b0ac6e602

VetusLignum a scris:Un raport excelent (în italiană/engleză)
https://www.raiplay.it/video/2020/11/SA ... f75ff.html